Các đơn vị trực thuộc Viện Vật lý Địa cầu theo Quyết định số 202/QĐ-VHL ngày 25/02/2013 của Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam:
1. Phòng Quản lý tổng hợp
2. Các phòng chuyên môn:
+ Phòng Địa chấn
+ Phòng Địa từ
+ Phòng Quan sát động đất
+ Phòng Vật lý khí quyển
+ Phòng Địa vật lý
+ Phòng Địa động lực
+ Phòng Vật lý kiến tạo
+ Đài Điện Ly
3. Trung tâm Báo tin động đất và cảnh báo sóng thần
Đơn vị mới thành lập theo Quyết định số 369/QĐ-VLĐC ngày 03 tháng 9 năm 2013 của Viện Vật lý Địa cầu:
+ Trung tâm Ứng dụng vật lý địa cầu
Nhân sự: tổng số CBVC : 98 người (không kể số hợp đồng khoán gọn bảo vệ các trạm động đất), trong đó:
+ Số biên chế: 73
+ Số hợp đồng (từ 12 tháng trở lên): 25
+ GS: 03 (kể cả hợp đồng cộng tác viên)
+ PGS: 06 (kể cả hợp đồng cộng tác viên)
+ TSKH 02 (cả hợp đồng cộng tác viên)
+ TS: 17 (kể cả hợp đồng cộng tác viên)
+ ThS: 25
+ ĐH: 27
+ KTV, QTV và các loại nhân viên khác: 31.